Không cần dụng cụ để vệ sinh máy xay Ninja. Hệ thống Mega Kitchen, máy xay Professional, Nutri Ninja và máy xay Ultimate đều yêu cầu các phương pháp làm sạch giống nhau. Bệ động cơ được lau sạch bằng khăn ẩm và bình đựng, nắp đậy, lưỡi dao và các bộ phận phụ trợ an toàn cho máy rửa bát.
Trong khi bình đựng được làm sạch trên giá dưới cùng của máy rửa bát, các mảnh nhỏ hơn được đặt trên giá trên cùng. Một cách khác để làm sạch máy xay sinh tố Ninja là đổ đầy nước ấm vào 3/4 máy, thêm một lượng nhỏ nước rửa bát, đậy nắp và nhấn PULSE vài lần. Sau khi máy xay sạch sẽ, tất cả các thành phần được rửa dưới vòi nước. Không nên cất máy xay cho đến khi các mảnh đã khô hoàn toàn.
